O Potiguar 2012 está dividido em dois turnos - a Taça Cidade do Natal e a Copa Rio Grande do Norte - cada um formado por uma primeira fase com 9 rodadas, duas partidas semifinais e a decisão do turno em dois jogos. Ao final de cada primeira fase, os quatro primeiros colocados se classificam às semifinais; os vencedores das semifinais decidem cada turno. O time campeão de cada turno ganha vaga à Copa do Brasil 2013. Em caso de campeões diferentes em cada turno, será realizada a final do campeonato, em dois jogos decisivos. O último colocado na classificação geral será rebaixado.